Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG6

CCPG1, Cell cycle progression protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCPG1Q9ULG6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCPG1Q9ULG6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCPG1Q9ULG6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCPG1Q9ULG6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCPG1Q9ULG6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCPG1Q9ULG6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCPG1Q9ULG6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCPG1Q9ULG6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms