Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDAC9Q9UKV0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDAC9Q9UKV0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms