Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJD2Q9UKL4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GJD2Q9UKL4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms