Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS51Q9UID3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS51Q9UID3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms