Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPA4Q9UI42 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPA4Q9UI42 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
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