Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USP25Q9UHP3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP25Q9UHP3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms