Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms