Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP2Q9UHC6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP2Q9UHC6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms