Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
MLH3Q9UHC1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
MLH3Q9UHC1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms