Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP4Q9UGJ1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms