Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARHGAP28Q9P2N2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARHGAP28Q9P2N2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGAP28Q9P2N2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms