Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC45.41■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC45.4■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC45.4■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC45.4■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC45.39■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.39■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC45.39■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.38■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC45.38■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
CCDC180Q9P1Z9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC45.38■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.37■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC45.36■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC45.36■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.36■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC45.35■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC45.34■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC45.34■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC45.34■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC45.34■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.34■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.34■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC45.33■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC45.33■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC45.33■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.33■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.32■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC45.32■■■■■ 4.85
CCDC180Q9P1Z9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC45.32■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC45.32■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC45.31■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC45.3■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC45.29■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.27■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC45.26■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC45.26■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
CCDC180Q9P1Z9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC45.25■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC45.25■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC45.25■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.25■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC45.24■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC45.24■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC45.23■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC45.23■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC45.23■■■■■ 4.83
CCDC180Q9P1Z9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms