Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ARHGEF12Q9NZN5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms