Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNK4Q9NYG8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms