Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDIT4Q9NX09 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms