Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM28Q9NW13 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM28Q9NW13 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms