Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FOXD4L1Q9NU39 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXD4L1Q9NU39 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms