Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB4Q9NTQ9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms