Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPMQ9NSP4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms