Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ABCC13Q9NSE7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCC13Q9NSE7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCC13Q9NSE7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCC13Q9NSE7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCC13Q9NSE7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCC13Q9NSE7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCC13Q9NSE7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCC13Q9NSE7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCC13Q9NSE7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCC13Q9NSE7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCC13Q9NSE7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCC13Q9NSE7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCC13Q9NSE7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCC13Q9NSE7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCC13Q9NSE7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCC13Q9NSE7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCC13Q9NSE7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCC13Q9NSE7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCC13Q9NSE7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCC13Q9NSE7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCC13Q9NSE7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms