Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FARSBQ9NSD9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FARSBQ9NSD9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FARSBQ9NSD9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms