Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL1Q9NSC2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SALL1Q9NSC2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL1Q9NSC2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms