Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VPS45Q9NRW7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms