Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB6BQ9NRW1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB6BQ9NRW1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB6BQ9NRW1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB6BQ9NRW1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB6BQ9NRW1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB6BQ9NRW1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB6BQ9NRW1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB6BQ9NRW1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms