Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRN4Q9NRL3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRN4Q9NRL3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRN4Q9NRL3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRN4Q9NRL3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRN4Q9NRL3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRN4Q9NRL3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRN4Q9NRL3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRN4Q9NRL3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRN4Q9NRL3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRN4Q9NRL3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRN4Q9NRL3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRN4Q9NRL3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRN4Q9NRL3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRN4Q9NRL3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRN4Q9NRL3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
STRN4Q9NRL3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRN4Q9NRL3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRN4Q9NRL3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRN4Q9NRL3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
STRN4Q9NRL3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
STRN4Q9NRL3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
STRN4Q9NRL3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
STRN4Q9NRL3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
STRN4Q9NRL3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
STRN4Q9NRL3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
STRN4Q9NRL3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms