Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DUOX1Q9NRD9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
DUOX1Q9NRD9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DUOX1Q9NRD9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms