Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPNPEP3Q9NQH7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPNPEP3Q9NQH7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms