Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRIP3Q9NQ35 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRIP3Q9NQ35 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRIP3Q9NQ35 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NRIP3Q9NQ35 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NRIP3Q9NQ35 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NRIP3Q9NQ35 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NRIP3Q9NQ35 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms