Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP13A2Q9NQ11 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP13A2Q9NQ11 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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