Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLRC4Q9NPP4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRC4Q9NPP4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms