Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRHQ9HD43 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRHQ9HD43 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRHQ9HD43 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRHQ9HD43 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRHQ9HD43 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRHQ9HD43 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRHQ9HD43 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRHQ9HD43 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRHQ9HD43 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRHQ9HD43 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRHQ9HD43 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRHQ9HD43 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRHQ9HD43 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms