Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KIAA1549Q9HCM3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KIAA1549Q9HCM3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms