Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CENPJQ9HC77 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CENPJQ9HC77 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CENPJQ9HC77 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CENPJQ9HC77 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CENPJQ9HC77 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CENPJQ9HC77 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CENPJQ9HC77 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CENPJQ9HC77 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CENPJQ9HC77 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CENPJQ9HC77 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CENPJQ9HC77 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CENPJQ9HC77 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CENPJQ9HC77 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CENPJQ9HC77 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CENPJQ9HC77 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CENPJQ9HC77 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CENPJQ9HC77 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CENPJQ9HC77 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms