Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP29Q9HBJ7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP29Q9HBJ7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms