Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP110Q9HB58 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP110Q9HB58 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SP110Q9HB58 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP110Q9HB58 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP110Q9HB58 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP110Q9HB58 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SP110Q9HB58 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP110Q9HB58 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP110Q9HB58 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP110Q9HB58 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP110Q9HB58 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP110Q9HB58 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP110Q9HB58 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP110Q9HB58 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP110Q9HB58 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP110Q9HB58 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP110Q9HB58 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP110Q9HB58 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP110Q9HB58 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SP110Q9HB58 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP110Q9HB58 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP110Q9HB58 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms