Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y2

RPF1, Ribosome production factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF1Q9H9Y2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPF1Q9H9Y2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPF1Q9H9Y2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms