Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C10orf88Q9H8K7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C10orf88Q9H8K7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms