Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf33Q9H7E9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf33Q9H7E9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf33Q9H7E9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf33Q9H7E9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C8orf33Q9H7E9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf33Q9H7E9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf33Q9H7E9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf33Q9H7E9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf33Q9H7E9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf33Q9H7E9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf33Q9H7E9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf33Q9H7E9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf33Q9H7E9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C8orf33Q9H7E9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf33Q9H7E9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf33Q9H7E9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf33Q9H7E9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf33Q9H7E9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf33Q9H7E9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf33Q9H7E9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf33Q9H7E9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf33Q9H7E9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf33Q9H7E9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf33Q9H7E9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf33Q9H7E9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms