Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C11orf49Q9H6J7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms