Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H9

SRCIN1, SRC kinase signaling inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCIN1Q9C0H9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRCIN1Q9C0H9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRCIN1Q9C0H9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms