Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms