Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOL6Q9BWW8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
APOL6Q9BWW8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms