Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
THUMPD2Q9BTF0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
THUMPD2Q9BTF0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms