Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERPUD2Q9BSE4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERPUD2Q9BSE4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms