Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RIOK1Q9BRS2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms