Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MESP1Q9BRJ9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms