Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQJ4

TMEM47, Transmembrane protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM47Q9BQJ4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM47Q9BQJ4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM47Q9BQJ4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms