Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHDC3Q9BQ90 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms