Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VGLL1Q99990 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms