Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms